Günter Froeschl ist Arzt und Spezialist für Infektionskrankheiten und Tropenmedizin. Er arbeitet als wissenschaftlicher Direktor und Leiter der Lehr- und Ausbildungseinheit der Abteilung für Infektionskrankheiten und Tropenmedizin der LMU München (DIDTM). Am DIDTM war er unter anderem verantwortlich für den Aufbau des ersten Doktorandenprogramms an der Medizinischen Fakultät der LMU, des PhD-Programms Medical Research - International Health. Er ist Vorstandsmitglied des Center for International Health (CIH) der LMU und der humanitären Organisation Médecins du Monde, Deutschland. Er war für verschiedene humanitäre Organisationen vor allem auf dem afrikanischen Kontinent im Einsatz, wo er sich mit der Stärkung von Gesundheitssystemen, Programmen zur Bekämpfung von Infektionskrankheiten und der Arbeit mit Flüchtlingen in unterschiedlichen Situationen befasste.

Er ist Mitglied des CAS-Schwerpunkts „Global Health“.